مجلس إدارة الوحدة هو السلطة المهيمنة على شئونها وتصريف أمورها ووضع السياسة التي تحقق أهدافها، ويتولى مجلس إدارة الوحدة إقرار السياسات، وبرامج ونظم العمل التي تحقق أغراض الوحدة في ضوء إستراتيجية الجودة بالكلية، وفي إطار القوانين واللوائح المنظمة، وذلك على النحو التالي:

• إقرار السياسات العامة والخطط التى تحقق أهداف الوحدة. 
• وضع وإعتماد النظام الداخلي للعمل في الوحدة وتحديد الإختصاصات والتوصيف الوظيفي للعاملين بها ولجانها الداخلية المختلفة التي يتولى إعدادها مدير الوحدة ورؤساء فرق العمل. 
• إعتماد تشكيل اللجان الخاصة بتنفيذ مهام الجودة والإعتماد المقترحة من قبل الوحدة.
• إعتماد التقارير الدورية التي تقدم عن سير العمل بالوحدة.
• إعتماد العقود بالإتفاقات مع المتعاملين مع الوحدة.
• إعتماد اللوائح الإدارية والمالية والفنية الخاصة بالوحدة.
• إعتماد الأجور والمكافئات بالوحدة في ضوء اللوائح التي يعرضها مجلس إدارة الوحدة.
• عقد إجتماعات وندوات ومؤتمرات بالتعاون مع الجهات الأخرى الموجودة بالجامعات وخارجها.
• إعتماد الخطة السنوية للوحدة.
• إقتراح تعديل هذه اللائحة كلما تتطلب الأمر.
• إقتراح تعديل وتطوير الهيكل التنظيمي والوظيفي للوحدة عند الضرورة وإتخاذ إجراءات إعتماده من السلطة المختصة.